Michelle Forbes

Lincolns henrettelse er planlagt å skje neste dag, og Veronica tar kontakt med han. Hun skaffer seg samtidig en ny alliert i pressen. I mellomtiden må Michael prøve å finne en måte å få Lincoln ut av isolat, og de innsatte risikerer alt når de prøver seg på sitt livs fluktforsøk.

En serie tilbakeblikk viser hvordan Lincoln, Sucre, C-Note, T-Bag og dr. Sara endte opp i Fox River fengsel, og hva som drev Michael til å pønske ut sin omfattende plan for å få sin fortapte bror ut av fengselet.

Lincoln, som tror han ser faren sin under henrettelsen, får en utsettelse på to uker når en dommer beordrer at Steadmans lik skal graves opp. Sucre henter inn en tjeneste, så Michael får muligheten til å sjekke ut en ny rute til sykestuen gjennom det kompliserte avløpssystemet.

Dr. Sara er usikker på om hun skal la nøkkelen stå i døra for Michael, som på sin side må forråde Pope for å få gjennomført rømningsplanen. Veronica finner bevis som fører henne i retning av Montana, men innser at hennes nærmeste allierte faktisk kan være hennes største fiende. Michael, Lincoln og de andre innsatte rømmer, og når alarmen går, finner de ut hvem som kommer seg over muren, hvem som blir igjen, og hvem som må forlate fengslet i en likpose.

Den mystiske mannen avslører identiteten sin til Lincoln, i tillegg til sin tilknytning til dårlige mennesker. Når Michael innser at Sara er nøkkelen til rømningsplanen, tar han forholdet deres til et nytt nivå. Fox River blir åsted for en lynsjing når et kjent ansikt kommer tilbake. Tweener må velge side, og Bellick får endelig oppdage sannheten om «nøkkelpersonen».

Mens Michael sliter med å huske manglende deler av fengselstegningene, plasserer fangevokter Pope ham på isolasjon når han nekter å tyste. I mellomtiden blir Sucre igjen for å dekke over rømningshullet i vaktenes rom, før en gjeng med snekkere får mulighet til å finne det.