GSG-9 対テロ特殊部隊

ゲープ率いるGSG-9「チーム50」はテロリストのハムザ兄弟の確保に向かうが、弟には逃げられ、サブリーダーのアンディは撃たれて重傷を負ってしまう。チーム50には新人のフランクが入隊し、サブリーダーに負傷したアンディに代わってコニーが抜擢される。その矢先、弟のイシャーンはアメリカの水泳選手団を人質に取り、兄の釈放を要求。犯人の裏をかき、チーム50は人質の救出に成功するが…。

WHO (世界保健機関) 総会に暗殺予告が届き、チーム50は予告状にかかれていた建物に向かう。そこには天然痘にかかって死にかけている男がおり、彼に近づいたフランクは天然痘に感染してしまう。男が持っていた小包には謎の団体からのビデオレターが入っていて、WHOが対アフリカ支援を行わなければ、天然痘のウイルス爆弾を爆発させるという。一方隔離されたままのフランクは、チームの活動にも関われず命の危機を感じる…。

テロ容疑がかけられたイスラム過激派の男を尾行していたチーム50は、男を逮捕するもさらなるテロの計画が発覚する。首謀者はオマー･マダーニ。彼には妊娠中のドイツ人の妻がいた。ゲープたちは彼女を監視することに決める。一方、チーム60がオマーの仲間の確保にあたるが、リーダーであるファルクが、オマーの仕掛けた爆弾で亡くなってしまう。

ドイツ大統領夫人の護衛としてベラルーシ外遊に同行したコニーとデミアだが、ドイツ大使館内で女に監禁されてしまう。ヤニナというその女は、体に爆弾を巻き付けていた。彼女の目的は母親と子供のいるドイツへの亡命。夫はベラルーシ政府の武器密売を告発しようとして秘密警察に殺されたのだという。大使館に踏み込んだ秘密警察は、ヤニナの身柄を要求するが…。

内通者がいるという疑いをかけられたチーム50。停職を命じられ、アンホフとともに事情聴取されることに。事情聴取を担当するのは内務省から派遣された調査官のシャフナー。彼女の尋問が進むにつれ、事件が浮き彫りにされていく…。今回の任務とは極右組織の新銃撃隊 (NSS) に潜入し、テロを未然に防ぐというものだった。

ゲープたちはコソボのドイツ軍駐屯地に出動を命じられる。今回の任務は、民間人虐殺の容疑がかけられているセルビアの元陸軍司令官ザラデビッチを、戦争犯罪人として逮捕し、さらに国際戦犯法廷へと移送するというものだった。ゲープたちはザラデビッチの逮捕には成功。しかしデミアが拉致されてしまい…。ゲープはザラデビッチとデミアの人質交換を要求する。