Kavi Ramachandran Ladnier

マサチューセッツ州ボストンで相次いで首なし遺体が発見される。金品は残されており、性的暴行の痕もなかったが、両手の指の骨が折られていた。被害者が皆、失踪直前に相乗りサービスを利用していたことも判明。リードは首を切った凶器がギロチンではないかと推理する。また、指の骨折が定規で繰り返したたかれたときのようだとロッシが気付き、サウスボストンにある学校と相乗りサービスのドライバーを照合すると…。

モヒンダーは、同じ夢を繰り返し見るようになる。それは自分の過去へとつながるものだった…。ピーターがネイサンに未来へのカギを見つけるために協力してほしいと頼む。

CIAの暗殺計画の発足メンバーが次々に死亡し、唯一の生存者であるキルブライドも命を狙われていることが発覚。暗殺計画を乗っ取ったモーガン･ミラーを追い、ワシントンのパーカーとトーレス、そしてハワイのテナントとルーシーもロスに飛ぶ。しかしキルブライドは姿を消し、ラウントリーが襲撃に遭って拉致され、さらに関係者全員が賞金首になっていることが判明。最悪の状況の中、各支局の捜査官が合同で決死の捜索を行う。

海軍の無人機を開発していた工場で爆発が発生し、清掃員が死亡。被害に遭った企業は以前からサイバー攻撃を受けており、爆発には高性能爆薬オクトーゲンが使われていたことから、チームは国家主導のテロを疑って捜査を進めていく。一方、シリアでヘティの偽名のIDを持った死体が発見され、体格も一致したことから、カレンとキルブライドは不安を抱えながら身元の確認を待つ。サムは施設の利用を拒む父親に手を焼く。

海軍大尉が自宅で刺殺され、現場から逃走した妻のアリスが第一容疑者として浮上。アリスは取り調べで口を閉ざすが、ディークスだけは彼女の秘密に気づき、自らの過去を打ち明けてアリスに寄り添う。一方、大尉が異動から1ヵ月後に死亡したため、カレンとサムは職務中の足取りを追い、大尉が自宅から離れた貸倉庫に足を運んでいたことを突き止める。そんな中、ディークスの母親が1人旅から戻り、ローザと初めて顔を合わせる。

チャーリーを人質に取られたヒロは、サミュエルの命令でモヒンダーの父親が残したフィルムを回収するために過去にタイムトリップする。そして、ついにサイラーが報いを受けるときが…!?