リンダ・ハミルトン

サラが姿を消し、部屋に引きこもっていたチャックは、サラの記憶が戻る方法があるかもしれないとエリーに言われ目を覚ます。チャックは、この5年間に築き上げたものすべてが、ニコラス･クインによって破壊されるのを絶対に阻止しようと決意する。家族、友達、そして意外な人物の協力を得てクインに立ち向かうチャック。だが、クインは想像を絶する方法でインターセクトを手に入れようとしていた。チャックとサラの5年間がフラッシュする、感動の最終回。

チャック、サラ、ケイシーの3人は、モロッコに飛ぶ。偽造貨幣の捜査をしているロン･モンゴメリーが、偽造組織に捕まり、彼を救出しなければならないからだ。そんな中、チャックとサラは、互いの将来についての意見が平行線をたどり、言い争う。一方、モーガンは、アレックスの母に会う。また、メアリーは、初めて母親らしくエリーに寄り添い、幸せを感じる。

チャックとモーガンは、チャックの母、メアリー･バトウスキーを捜し出すという任務を背負い、世界中を駆け回る。そして、サラとケイシーは、ヴォルコフ･インダストリーという謎めいた企業を支配する男、マルコを追ってロシアに来ていた。一方、チャックは、うれしいニュースを伝えようと彼の帰りを待っていたエリーに、スパイ生活に戻る話を切り出せなくなる。

結婚式を目前にし、式の準備の最終チェックをするチャックとサラ。2人の最大の願いは、メアリーが無事に式に参加することだ。そんな中、新郎の介添人を務めるモーガンは、武器商人を装いモスクワのオークションに潜入するという危険極まりない任務を命じられる。そして、メアリーは、チャックたちの心配をよそに、モーガンの護衛は私とケイシーに任せて、と言うのだった。

サラは、メアリー･バトウスキーを救出するため、多大な危険を承知の上でヴォルコフに接近するが、チャックはそんな彼女を事態に深入りしすぎていると心配する。だがサラは、ヴォルコフとの間で交わされた極秘の任務を遂行するために、チャックとモーガン、ケイシーに援護を要請する。一方、エリーとデヴォンは、子供の名前について意見が合わず言い争う。

ホイールライト博士が、自分が開発した装置で毒ガスをまき散らそうとし、チャック、サラ、ケイシー、モーガンの4人は、博士を止めようと必死になる。そんな中、チャックは、自分の母が誰のスパイなのか把握できず、焦り始める。ハロウィーンを目前にした バイ･モアの店内は、ユニークで不気味に飾りつけられ、エリーとデヴォンは もうすぐ生まれる赤ちゃんのために準備を進める。