Marshall Allman

Meredithin ja Derekin lääkekokeilu saa vielä yhden mahdollisuuden. Kirurgit vapauttavat yhteisvoimin poikaa sementtilohkareesta. Lexie saa tietoja Georgen erikoistumisjaksosta.

Tuotantokauden avausjaksossa Michael Scofield on Sonan helvetillisessä ja hengenvaarallisessa panamalaisvankilassa, jossa äskettäinen mellakka on pakottanut virkavallan tiehensä ja jättänyt vangit vastuuseen omasta elämästään (ja kuolemastaan). Michaelin läheiset ovat vaarassa, ja hänen on nyt etsittävä käsiinsä mystinen vanki Whistler, joka piileskelee vankilan viemäriverkossa, paetakseen läpäisemättömästä vankilasta. Samalla Lincoln etsii kateissa olevaa Saraa ja saa huolestuttavia uutisia LJ:stä.

Michael saa uskomattomia uutisia Los Angelesissa janotessaan kostoa Whistleriä ja Gretcheniä kohtaan Saran kuolemasta, ja Mahone kärsii suuresta menetyksestä. Lisäksi Michael ja Lincoln palaavat muiden mukaan ja saavat Yhdysvaltain turvallisuusviraston agentilta lyömättömän tarjouksen.

Michael haluaa päättäväisesti puhumaan Saralle ja turvautuu T-Bagin apuun päästäkseen käyttämään Sonan ainoaa puhelinta, joka kuuluu Lecherolle. Lincoln yrittää suorittaa uskaliaan pelastuksen, kun taas Whistler tunnustaa jotain Michaelille. Mahone uhkaa palata huonoihin tapoihinsa, ja Bellick saa vihollisen yrittäessään nousta takaisin tolpilleen.

Kaksiosaisessa erikoisjaksossa vanki löytyy murhattuna, ja Whistleristä tulee pääepäilty. Michaelin on todistettava Whistlerin syyttömyys pelastaakseen tämän hengen. Michael myös vaatii Susanilta todisteita siitä, että Sara on elossa, ja uhkailee peruuttavansa paon. Lincoln ja Sofia panevat merkille vartijoiden aamurituaaleja, ja Mahonen saama tarjous voi olla hänen tiensä ulos Sonasta.

Michael, Whistler ja McGrady karkaavat Sonasta. Kaikki ei kuitenkaan mene suunnitelmien mukaan, ja pakomatka vaarantuu.