Neon Genesis Evangelion

Al llegar a Tokio-3, el joven Shinji Ikari se encuentra con una feroz batalla entre un Ángel, un horror que amenaza la propia existencia de la humanidad, y el ejército de las Naciones Unidas. Bajo la dirección de Misato Katsuragi, se dirige al cuartel general de la organización especial NERV.

Tras pilotar el EVA-01 y sobrevivir a la feroz batalla con el Ángel, Shinji es acogido por Misato. Una ciudad desconocida con gente desconocida. Incluso el techo que observa en el apartamento de Misato le resulta desconocido. Shinji está atormentado por recuerdos de la desesperada lucha contra el Ángel. Lo que vio después de eso fue...

Después de ser transferido a su nuevo instituto de secundaria, Shinji es incapaz de hacer amigos. Sus compañeros de clase se emocionan cuando descubren que es un piloto de EVA. Tiene un conflicto con Toji, cuya hermana menor resultó herida en la batalla entre el EVA y el Ángel.

Incapaz de adaptarse a su nuevo entorno, Shinji abandona el apartamento de Misato como si quisiera escapar de la realidad. Deambula por las calles de Tokio-3 sin rumbo fijo. Encuentra un breve momento de respiro con su compañero de clase Kensuke, pero a la mañana siguiente es recogido por los adultos de NERV.

Rei Ayanami es una joven que no muestra ninguna emoción y no se relaciona con los demás más de lo necesario. Shinji intenta aproximarse a ella, ya que tiene una relación más cercana con su propio padre que él mismo, pero ella no muestra ningún indicio de abrirle su corazón. Rei critica a Shinji por no confiar en su padre y le da una bofetada. Mientras tanto, un Ángel se acerca a Tokio-3.

Shinji se encuentra al borde de la muerte después de recibir un ataque directo del rayo de partículas del Quinto Ángel. Mientras tanto, Misato idea y ejecuta la Operación Yashima para derrotar al Ángel, que tiene capacidades ofensivas y defensivas casi perfectas, aprovechando toda la electricidad de Japón y disparándola con un cañón de positrones desde una distancia extremadamente lejana.