Peter DaCunha

Un tentativo di distruggere il virus cambia il futuro e Cole si ritrova bloccato nel 2016, con un'instabile Jennifer Goines, che potrebbe essere la chiave per tornare a casa.

Quando Cole e Cassie restano bloccati nel 1944, la Jones deve rivolgersi alla persona di cui meno si fida per riportarli a casa: Ramse.

Il sodalizio tra Cole (Aaron Stanford) e Ramse (Kirk Acevedo) viene messo alla prova quando i due tornano nella New York degli anni '70 per impedire ai Dodici di uccidere uno squilibrato veterano del Vietnam, collegato al Testimone.

Cole si scontra con il Testimone, il fantasma dietro l'Esercito delle 12 Scimmie, quando le allucinazioni di Cassie (Amanda Schull) subiscono una raggelante evoluzione. A peggiorare le cose, la Struttura Temporale diventa sempre più pericolosa, per un malfuzionamento della Macchina, che lacera Tempo e Spazio, risucchiando letali visitatori dal Passato.

Nonostante la crescente tensione tra loro, Cole (Aaron Stanford) e Cassie (Amanda Schull) intraprendono la loro prima missione insieme nel passato, frammentandosi a New York al culmine della Seconda Guerra Mondiale. In questa epoca lontana e "seppiata", i due individuano un pericoloso membro dei Dodici, una seduttrice con una missione omicida, che potrebbe distruggere il Tempo stesso.

Cole e Cassie hanno finalmente trovato la pace vivendo nel passato. Quando una misteriosa donna con visioni apocalittiche del futuro dice a Cole che non è finita, egli deve fare l'impensabile per salvare il mondo... e la donna che ama.