David Cronenberg

Na een schokkende ontdekking in de woestijn stemt Sydney in met een experimentele procedure van een excentrieke arts om haar verloren herinneringen terug te halen. Lauren brengt een groot offer om haar alibi geloofwaardig te maken voor Lindsey, nadat ze Sydney heeft bevrijd uit handen van de NSC. Sloane wordt ingesloten door een onwaarschijnlijke vijand die voorgoed wil afrekenen met Sydney Bristow.

Sydney vertelt Jack over een droom waarin Will voorkwam. De identiteit van de mysterieuze 'St. Aidan' dwingt Sydney om een verbijsterde Will uit het getuigenbeschermingsprogramma te halen. Maar de achtervolging brengt de twee oude vrienden op ramkoers met Allison, de vrouw die hun beider levens verwoestte. Intussen worden Jack en Vaughn door een ijverige Lindsey gearresteerd omdat ze Sydney hielpen ontsnappen uit handen van de NSC. Sloane stelt onder druk van Lindsey een plan in werking om Sydney uit te schakelen.