David Nykl

Von der Erde aus wird ein neues Militärkontingent entsandt um das Kommando in Atlantis zu übernehmen und den Ort vor dem bevorstehenden Wraith-Angriff zu verteidigen.

Teyla die von schrecklichen Alpträumen geplagt wird erinnert sich an die Zeit als sie und ihr Vater von den Wraith gefangengehalten wurden und Experimente über sich ergehen lassen mussten. A

Mehrere Bewohner von Atlantis haben sich mit dem tödlichen Nanitenvirus infiziert sodass die gesamte Stadt abgeriegelt werden muss.

Eine Fehlfunktion des Antriebs an Bord einer rätselhaften Doppelgänger-Daedalus sorgt dafür dass das Team durch verschiedene Parallelwelten springt wo es auf düstere außerirdische Lebensformen eine glühend heiße Sonne und einen Kampf um Atlantis trifft.

Ein rätselhaftes Wesen löst in den Computersystemen der Stadt ein lähmendes Chaos aus.

Als ein rätselhafter Alienorganismus Dr. Keller als Wirt nutzt suchen Beckett und die Besatzung verzweifelt nach einem Serum um sie vor dem Eindringling zu beschützen bevor er Atlantis infiltrieren kann.